《隔离差馆有只鬼》讲述的是军装警员张全直（黄日华）一次意外将压在关帝像下压着的清朝鬼阿贵放走，阎王允许阿贵暂借警察毛勇桂（罗清浩）的身体来做一百件好事来让其轮回。期间，直与其女朋友凌巧儿（关咏荷）发生很多误会。直既失意于爱情，惟寄情于工作，得桂之助，破获大案，并与儿修好。桂在轮回前要回清朝解决未了事，并希望顺手为香港解决九七问题，但阴错阳差，最终……